Mindaugų parapija buvo įkurta 1941 m. energingo Kalvarijos klebono dekano prelato Mykolo Krupavičiaus rūpesčiu. Šios parapijos atsiradimas ir vardas slepia unikalią vietos bendruomenės taikinimo istoriją.

Kuriant parapiją, tarp gretimų Kamšų ir Sūsninkų kaimų gyventojų kilo dideli nesutarimai – abi pusės norėjo, kad naujoji parapija būtų pavadinta būtent jų kaimo vardu. Siekdamas numalšinti ginčus, prelatas M. Krupavičius pasiūlė kompromisą. Jis paragino parapiją pavadinti Lietuvos karaliaus Mindaugo vardu, primindamas, kad šis valdovas prieš daugelį metų suvienijo besipykstančius kunigaikščius į vieną galingą valstybę. Šis garbingas istorinis vardas sutaikė vietos žmones, o vietovė bei parapija iki šiol vadinama Mindaugais.

Paskatintas M. Krupavičiaus, bažnyčios projektą parengė Juozas Auštrevičius (1888–1969) – savamokslis inžinierius, kuris prieš tai ilgą laiką gyveno Amerikoje, o grįžęs į Lietuvą nusipirko žemės Kamšų kaime. Darbai vyko stebėtinai greitai ir jau 1941 m. vasarą naujoji Šv. Mykolo bažnyčia buvo oficialiai įšventinta.